這個特別的建筑物呈三角形結構，分為三層。

NLé是一家為城市發展提供建筑設計方案的機構，也是拉各斯水上學校的設計者和承建方。該機構建筑師孔勒·阿德耶米說，馬科科社區土壤特別疏松，而漂浮水上的設計正好避開了這一難題。他還指出，當地水平面經常改變，所以他們設計時也考慮了這一情況。

阿德耶米的設計在馬科科貧民窟得到推廣，除了這座水上學校，這里今年9月還會建成多處水上房屋，以替代那些破敗簡陋的棚屋。拉各斯最終將形成一個由水上學校和水上房屋等組成的水上社區，該項工程預計2014年底竣工。

此外，阿德耶米還希望自己的設計理念和作品能推廣到非洲其他沿海城市，造福于那里的民眾。