有專家表示，《網絡發票管理辦法》的出臺施行，主要目的是為“對電商征稅”做準備，但征稅對象主要是像B2C商城這樣的電商公司，或者平臺入駐公司，因為公司本身就應該繳納稅收，而對于個人網店，暫時不會征稅。電商分析師李成東也認同這種觀點。
李成東：電子商務剛剛在試運行，目前沒看到細則出來，傳統的正規企業從稅費覆蓋面來講，并不適合所有網購商戶，像京東、蘇寧都會交稅，但是淘寶都是個人賣家，都是成本價，所以基本不怎么交稅。
李成東同時還表示，京東淘寶繳稅，小商戶不用交稅，這很不公平，但一旦讓大家都繳稅，對小商戶的沖擊就太大了。
李成東：美國在推行整個征稅試點，公平競爭嘛，線上渠道也要公平競爭，京東戶民都交稅，淘寶商務不交稅，相對來講不公平。
要推廣網絡發票，稅務總局還必須解決一些技術問題。比如建立強大的數據庫、防止黑客攻擊、加大推廣和監管力度、防止電商偷稅漏稅。電子商務專家魯振旺表示，從技術上，稅務部門可以實現與所有買家店鋪數據對接。
魯振旺：在技術上是可以實現的，因為原來這種方式都要發票管理、統計，都是在網上進行的，網店也好、B2C也好，在這個系統里面有一個獨立賬戶就可以操作了，而且都是自動進行稅務統計的。
此外，魯振旺還表示，網絡發票的推廣是大勢所趨，但是否對應該對那些小網店征稅，確實還需要商榷。
魯振旺：現在B2C對發票的要求，需要一個細則出來，比如個人網店是不是要征稅，這里面有很多可以考慮的地方，比如對于經營本地業務的店鋪免稅。
